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pcr挖矿计算

发布时间: 2022-06-16 21:31:19

❶ pcr中如何计算原始DNA

引物与DNA单链结合后即形成局部双链,即可在酶的作用下启动脱氧核苷酸链的合成,不断在引物的3端结合脱氧核苷酸.直至复制完成.

❷ 求PCR产物计算公式的推导,过程详细一点!!!

给您一个连接地址,文章是 PCR产物计算公式的推导与修正 http://www.cnki.com.cn/Article/CJFDTotal-YNSK200901014.htm
希望能对您有帮助。谢谢!

❸ 做荧光定量PCR时,它的计算公式是什么

Ct=-1/lg(1+Ex)*lgX0+lgN/lg(1+Ex)。

n为扩增反应的循环次数,X0为初始模板量,Ex为扩增效率,N为荧光扩增信号达到阈值强度时扩增产物的量。

起始拷贝数越多,Ct值越小。利用已知起始拷贝数的标准品可作出标准曲线,其中横坐标代表起始拷贝数的对数,纵坐标代Ct值。因此,只要获得未知样品的Ct值,即可从标准曲线上计算出该样品的起始拷贝数。

(3)pcr挖矿计算扩展阅读

传统定量PCR方法简介:

1)内参照法:在不同的PCR反应管中加入已定量的内标和引物,内标用基因工程方法合成。上游引物用荧光标记,下游引物不标记。

在模板扩增的同时,内标也被扩增。在PCR产物中,由于内标与靶模板的长度不同,二者的扩增产物可用电泳或高效液相分离开来,分别测定其荧光强度,以内标为对照定量待检测模板。

2)竞争法:选择由突变克隆产生的含有一个新内切位点的外源竞争性模板。在同一反应管中,待测样品与竞争模板用同一对引物同时扩增(其中一个引物为荧光标记)。

扩增后用内切酶消化PCR产物,竞争性模板的产物被酶解为两个片段,而待测模板不被酶切,可通过电泳或高效液相将两种产物分开,分别测定荧光强度,根据已知模板推测未知模板的起始拷贝数。

❹ 求助:PCR扩增效率的如何计算

在网上搜到了两个计算realtime PCR扩增效率的公式,但相互不同,不知哪个才是正确的。请大家明辨!
第一种计算:

两个都是通过标准曲线法计算扩增效率,其实是一样的,按照定义理解,完全扩增的话1条变2条,2条变4条,扩增效率200%,但一般通过软件计算都是提供第一种方法(用的比较多),扩增效率最大为100%。本质上两者是相同的。

❺ PCR中Tm值如何计算

引物设计软件都可以给出Tm,引物长度,碱基组成,引物使用缓冲的离子强度有关。
长度为25mer以下的引物,Tm计算公式为:Tm = 4℃(G + C)+ 2℃(A + T)
对于更长的寡聚核苷酸,Tm计算公式为:
Tm = 81.5 + 16.6 x Log10[Na+] + 0.41 (%GC) – 600/size
公式中,Size = 引物长度。

❻ pcr扩增时如何计算各组分的体积(即各种物质根据反应总体积,如何确定其他物质的体积)

固定的反应试剂:比如buffer,dNTP,酶的用量一般都是固定的,按照protocol给出的要求加。
关键是模板和引物的量。模板不能加太多,一般是50ul体系10-100ng左右,体积根据你DNA模板的浓度确定,比如你的DNA浓度是100ng/ul,你加1微升就够了。如果浓度太高,适当稀释一下。
引物的浓度一般是终浓度0.2uM。把引物稀释成10uM的,加1微升到50ul体系里头。最后用水补齐到50ul。加的时候最好先加水,再加buffer,然后模板,引物,最后加酶。冰上操作。

❼ 有关pcr目的基因的计算问题

那是指从一个大片断模板中扩一个相对小一点的片断。第一轮扩增以后,得到的并不是目的产物,(可以参考下图),可以这样理解,如果变性在复性后,得到原来的模板,加一对(两条链)两端凸出中央互补的产物,因为有模板的存在,这个产物每一轮都会增加一个,以线形扩增N轮后有N个。

我们知道总的扩增产物(双链)是指数增长的,N轮后为2^N个(N为循环数);

第三轮才开始目的产物的指数扩增。在最后的产物中可以认为有模板、两端凸出中央互补的产物(实际上很可能模板的链和非特异产物的链互补在一起)以及特异的产物

因此目的产物=总产物-非目的产物-模板=2^N-N-1

经四轮后为16-4-1=11

其实你只要记住上面公式就行了

❽ PCR模板怎么算

Ct=-1/lg(1+Ex)*lgX0+lgN/lg(1+Ex)。

n为扩增反应的循环次数,X0为初始模板量,Ex为扩增效率,N为荧光扩增信号达到阈值强度时扩增产物的量。

起始拷贝数越多,Ct值越小。利用已知起始拷贝数的标准品可作出标准曲线,其中横坐标代表起始拷贝数的对数,纵坐标代Ct值。因此,只要获得未知样品的Ct值,即可从标准曲线上计算出该样品的起始拷贝数。

注意事项

首先是确定的总体积,可以选择10ul, 20ul, 50ul等。

其次是根据mix,算出总体积中mix使用的体积。

根据自己提取或者逆转录得到的DNA浓度,以及一次pcr反应所使用模板的量,计算出DNA的体积。

根据引物浓度以及引物使用的终浓度,计算出引物使用的量。

最后用总体积减去上面几部分的体积,得到的就是水的体积。

❾ pcr 灰区怎么计算

引物设计软件都可以给出Tm,引物长度,碱基组成,引物使用缓冲的离子强度有关。
_ざ任?25mer以下的引物,Tm计算公式为:Tm=4℃(G+C)+2℃(A+T)
_杂诟さ墓丫酆塑账幔_m计算公式为:Tm=81.5+16.6xLog10[Na+]+0.41(%GC)_600/size公式中,Size=引物长度
_CR的原理是利用DNA在体外摄氏95°高温时变性会变成单链,低温(经常是60°C左右)时引物与单链按碱基互补配对的原则结合,再调温度至DNA聚合酶最适反应温度(72°C左右),DNA聚合酶沿着磷酸到五碳糖(5'-3')的方向合成互补链。
_CR最有价值的应用领域就是对感染疾病的诊断。理论上,只要样本有一个病原体存在,PCR就可以检测到。
_谑笛橹蟹⑾郑_NA在高温时也可以发生变性解链,当温度降低后又可以复性成为双链。因此,通过温度变化控制DNA的变性和复性,加入设计引物,DNA聚合酶、dNTP就可以完成特定基因的体外复制。
_牵_NA聚合酶在高温时会失活,因此,每次循环都得加入新的DNA聚合酶,不仅操作烦琐,而且价格昂贵,制约了PCR技术的应用和发展。

❿ pcr扩增计算

1个双链DNA经过10次扩增后,变为2的10次方=1024个,其中带有部分母链的较长的DNA片段有2乘以10=20个,目的基因数=1024-20=1004个,选D

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